Baseado no mangá de Seimaru Amagi e Fumiya Sato, Kindaichi Shounen no Jikenbo R gira em torno de Hajime Kindachi, neto do famoso detetive Kosuke Kindaichi. Apesar de parecer ser um simples estudante do ensino médio, quando casos difíceis chegam até ele, ao lado de sua amiga de infância Miyuki Nanase, do inspetor de polícia Isamu Kenmochi e de seu rival Kengo Akachi, Kindachi usará de todo seu poder de dedução para resolver cada mistério.